Normální funkcí kalprotektinu je tedy působit proti rozvoji bakterií a plísní v těle (antimikrobiální aktivita).
V přítomnosti „zánětu v gastrointestinálním traktu k němu migrují bílé krvinky a uvolňují protein, jehož koncentrace ve stolici se podle toho zvyšuje.
Z tohoto důvodu může být kalprotektin použit jako indikátor zánětu v případech chronických střevních onemocnění, některých infekcí bakteriálního původu nebo rakoviny trávicího systému.
Fekální dávka kalprotektinu je jediným testem, který může poskytnout informace o místě zánětu. Stanovení parametru v plazmě naopak zdůrazňuje zánětlivý stav, který lze lokalizovat kdekoli. Kromě toho u pacientů s chronickými zánětlivými onemocněními střev (jako je ulcerózní kolitida a Crohnova choroba) je dávka fekálního kalprotektinu platným indexem stupně zánětu.
; přítomný ve všech částech lidského těla, je koncentrován hlavně v cytoplazmě neutrofilních granulocytů.V nižších koncentracích je kalprotektin také přítomen v monocytech a v makrofágech, které z nich pocházejí; tyto buňky, podobné neutrofilům, jsou bílé krvinky určené k fagocytaci - tedy k englobuci, trávení a ničení - cizích částic, které pronikly do organismu, včetně mikroorganismů (vůči nimž jsou neutrofily aktivnější).
Neutrofily i makrofágy mají schopnost vylučovat chemické mediátory zánětlivé reakce.
V těchto imunitních buňkách vykazuje kalprotektin vysokou bakteriostatickou a mykostatickou aktivitu; jako takový účinně působí proti růstu hub a bakterií.
