Struktura a klasifikace virů

Nukleová kyselina je uzavřena v jakémsi obalu nebo obalu, nazývaném kapsida, a je tvořen opakováním proteinových podjednotek, tzv. kapsomeryzase vznikají opakováním jednoho, dvou nebo více proteinů. Například u papilomaviru je kapsida tvořena několika kopiemi dvou různých proteinů, L1 a L2; první, hojnější, má schopnost samoagregace a tvorby virionů bez nukleových kyselin (je velmi imunogenní, a proto se používá jako základ pro výrobu vakcín).

The jádro zaručuje viru schopnost provádět procesy množení a růstu, zatímco kapsida dává tvar a stabilitu virové částici, chrání její genom a je důležitá pro infekčnost (díky přítomnosti antireceptorových struktur).

Celkově vzato, kapsid a nukleová kyselina tvoří nukleokapsid.

V přírodě existují viry tvořené pouze nukleovými kyselinami a kapsidami, a proto se jim říká „nahé viry"; příkladem nahých virů jsou bakteriofágy. Existují také další virové částice, které kromě kapsidy představují vnější membránu, nazývanou perikapsid, peplos nebo maskovat (obálka), který pochází z plazmatické membrány hostitelské buňky a jako takový sestává převážně z fosfolipidů, ale také z polysacharidů a proteinů (obecně glykoproteinů). Viry s perikapsidem se nazývají „potažený virem"a obecně také mají proteinovou strukturu, nazývanou matrix nebo integument, umístěnou mezi kapsidou a perikapsidem."

Potažené viry - díky perikapsidovým fosfolipidům - snadněji pronikají do citlivých buněk a snižují imunitní odpověď hostitele; adenovirus, zodpovědný za příznaky konjunktivitidy a parainfluenzy, je příkladem potaženého viru, stejně jako všechny ostatní viry. Viry, které infikují eukaryoty.

Virový kapsid může normálně předpokládat dvě různé konformace, charakterizované jednou ikosahedrální typová struktura nebo šroubovicový.

Ikosahedron je těleso tvořené rovnostrannými trojúhelníky, které má 12 vrcholů, 20 ploch tvořených rovnostrannými trojúhelníky a 30 hran odpovídajících stranám trojúhelníků, přičemž vrcholy jsou body setkávání stran. Tato krystalografická struktura pochází z unie reguluje více bílkovin; každý z nich se nazývá monomer a tyto monomery se mohou spojit s pěti až pěti tvořícími pentony, nebo - u větších virů - 6 až 6 za vzniku takzvaných exonů. Sdružení pentonů a exonů tvoří eikosahedron, uvnitř kterého se nachází genetický materiál.

Ve druhé strukturní typologii kapsidy, zvané šroubovicové, jsou jednotlivé monomery uspořádány ve spirále kolem osy (proteiny jsou uspořádány jako schody po točitém schodišti) a vytvářejí dutý válec, který obklopuje nukleovou kyselinu.

Virus Tobacco Mosaic je typickým příkladem viru šroubovicové struktury, zatímco virus papilomu má ikosahedrální strukturu. Existují také viry, ve kterých kapsidě chybí symetrie a má smíšenou morfologii (například virus HIV, který se skládá z ikosahedrálního kapsidu a vláknitého jádra nukleové kyseliny).

Klasifikace virů

Každý virus je identifikován druhem, rodem a rodinou. Vezmeme -li například virus HIV, tento druh označuje obecný název mikrogranismu, což je virus získané imunodeficience nebo přesně HIV. Tento virus patří do rodu lentivirů (tj. S pomalým růstovým cyklem) a do retroviridae rodina (retroviry jsou viry s replikačním cyklem charakterizovaným dvěma formami nukleových kyselin, které představují enzym zvaný reverzní transkriptáza, schopný provádět reverzní transkripci transformující virovou RNA do DNA).

Každý virový druh je poté popsán na základě struktury (velikost, morfologie a typ nukleové kyseliny), typu replikace (jaderné nebo cytoplazmatické), hostitelské buňky (zvířata, houby, rostliny nebo bakterie), tropismu tkáně nebo orgán a typ přenosu (fekálně-orální, parenterální atd.).

Antivirové vakcíny

Antivirové vakcíny mohou být tvořeny usmrcenými (inaktivovanými), oslabenými viry (zachovaly si schopnost replikace, ale ztratily velkou část svého patogenního potenciálu) nebo virovými podjednotkami (vakcíny nové generace se vytvářejí například z virových perikapsidových proteinů, schopné stimulovat pasivní imunitu) .Přípravkem nové generace je vakcína proti hepatitidě B, založená výhradně na kapsidovém glykoproeinu viru HBV.